在创新成为企业、区域乃至国家获取竞争优势重要手段，“创新驱动发展”成为我国发展基本战略的时代背景下，“长三角创新发展研究院”作为南京工业大学以管理学科为代表的大文科在“争创一流学科”中寻求突破的重要平台，秉持“顶天立地、知行合一”的发展理念，以学术研究为核心，进行高水平科研活动和高层次人才培养工作，争创国内具有重要影响力的“智库”。其主要研究层次与领域包括：

l基础研究：创新是一个综合性问题，既涉及从知识创造到知识转化、技术创新、组织创新、市场创新等多个环节，也需借助认识论、认知心理及脑科学等多个学科。基础性、跨学科研究不仅有助于形成研究院发展的宽阔基础，也是高水平研究成果的重要“产地”。

l基础应用研究：以管理学与经济学为主，重点考虑社会学、心理学等学科的价值，在（1）技术创新，（2）组织与制度创新，（3）金融创新等多个领域，从企业、产业、区域等对个层次，针对相关重要问题及研究热点展开研究。

l应用研究：以江苏省、长三角等为主要对象开展应用研究和服务。